La Unidad de Ensayos Clínicos de CIMES participa en estudios de investigación clínica de fase I a IV, en colaboración con la industria farmacéutica, organismos públicos de investigación y grupos académicos. El centro cuenta con la autorización de la Agencia Española de Medicamentos y Productos Sanitarios (AEMPS) y cumple los estándares internacionales de BPC (Buena Práctica Clínica).